Depois de algum tempo, estas são as minhas conclusões:
- o problema está relacionado aos codecs de vídeo de origem e exportação que operam em diferentes espaços de cores (YUV vs. RGB); O problema de cor é baseado nisso e também reside no fato de que o H.264 não pode trabalhar com um canal alfa.
- embora exportando o vídeo para o QuickTime com algum codec com capacidade alfa, como o Animation ou o Lagarith, o vídeo resultante com 1 hora é muito grande para mim
- Acabei exportando para o H.264, afinal, e aplicarei alguns efeitos de alteração de cor no Premiere durante as etapas finais de processamento.
Este não é o fluxo de trabalho ideal para dizer o mínimo. Vou ter que dar uma olhada e encontrar uma maneira de evitar o uso do After Effects para isso.
Obrigado pelos comentários, pessoas.
Ondrej