Parece que o driver do touchpad padrão da Asus, além da versão mais recente disponível em sua página da web em março de 2014, apresenta bugs no Windows 8.1 e causa esse comportamento.
Eu resolvi meu problema removendo o driver Asus e instalando um driver touchpad genérico da Elan Tech. Acho que o pacote de instalação veio de um notebook da Samsung porque exibe um logotipo da Samsung na página de configurações avançadas do driver.
A instalação deste driver elimina totalmente a capacidade de rolar com dois dedos para a seção "todos os aplicativos" da tela inicial - o driver Asus parece temporariamente emular uma tela sensível ao toque (que, aliás, tem o hábito irritante de fazendo o ícone da barra de tarefas para o teclado de toque na tela reaparecer).
O driver genérico Elan Tech se comporta consistentemente como um touchpad e não faz nada de chato, então eu estou chamando este de resolvido. Talvez a Asus atualize seu driver no futuro, mas não estou muito preocupado com isso.