A maneira como eu costumava fazer isso: instalar dropbox em um sistema operacional. Definir o diretório padrão da caixa de depósito. Depois disso, o Dropbox começa a sincronizar arquivos.
Em seguida, desligue este sistema operacional e inicialize no outro. Esvazie o diretório da caixa de depósito. Em seguida, instale o dropbox e, novamente, defina o diretório dropbox padrão. O Dropbox começa a sincronizar novamente. Depois disso, ambos os sistemas operacionais têm o mesmo diretório de dropbox.