Eu tive um pouco o mesmo problema. O meu touchpad é um multitouch da Alps (Acer Aspire 7741G). Às vezes, ou depois de remover o mouse USB ou depois de sair da suspensão (não consigo descobrir exatamente qual deles, mas acho que um desses dois), meu touchpad pararia de funcionar. Eu tentei a maioria dos conselhos (psmouse, xinput, etc), nenhum funcionou. O logout faria o touchpad funcionar, mas apenas para a tela de login, após o login, ele pararia novamente. A reinicialização também não ajudou, assim como o logout.
ao contemplar a reinstalação do Ubuntu, eu tentei fazer o login com a conta de convidado. O mouse funcionou após o login! Então eu comecei a me perguntar se de alguma forma as configurações da minha conta (mantidas nos diretórios / arquivos .xxx no seu diretório home - você pode vê-las com o comando "ls -a", como ".config") estavam com defeito. Então eu fiz um backup de todos os meus diretórios / arquivos ocultos, e deletei todos eles (no login, se eles estiverem faltando, eles serão recriados, e você terá a área de trabalho que você tinha após a instalação).
E funcionou! Eu não descobri exatamente onde estavam as configurações erradas, mas suspeito que seja algo como ".config / unity". Se você não quer perder todas as suas configurações (navegador, transmissão, unidade, etc), você pode tentar fazer um backup e excluir sequencialmente até encontrar a fonte, depois disso restaurar aqueles que não tinham nada a ver com o problema. Eu não tive paciência e deletei todos eles e tive que refazer todas as configurações (com preguiça de copiar do backup).
Espero que isso ajude alguém!