Adicione discos rígidos. Vincule as pastas nos novos discos rígidos. Se os links antigos não forem mantidos, você poderá ajustá-los manualmente.
Ainda melhor opção obter um controlador RAID diz um Adaptec 5805,6805,7805, ou etc Conecte 8 discos rígidos de 2 TB e faça um RAID 6. Se 8 não for suficiente, você poderá obter gabinetes ou expansores de sata e aumentar para 254 unidades de disco rígido.
Agora você tem 1 pool gigante de armazenamento e formata-o ntfs. Copie tudo para ele e tenha muito espaço de armazenamento.
Quase todo o software de backup pode manipular links. Sugiro o Acronis True Image, mas dezenas de outros pacotes de software são igualmente bons.