Você percebe que provavelmente há uma versão para Linux do Matlab no mesmo CD, certo? É assim que geralmente é distribuído. Ele usa a mesma licença. Correndo isso em Wine é uma má idéia, o pensamento do meu espaço de trabalho quebrando enquanto tendo um monte de cálculos não salvos simplesmente não vale a pena para mim. Boa sorte.