Se eles são todos idênticos, eu usaria o dd neste caso.
Crie um disquete, use este comando para criar uma imagem do disquete depois de criá-lo em dd if=/dev/fd0 of=floppy.img
Então, quando você precisa de um disquete gerado, você pode escrever a imagem em um disquete
dd if=floppy.img of=/dev/fd0
Substituindo o / dev / fd0 pelo dispositivo de disquete, é claro.
Se as configurações forem diferentes, talvez um script que automatize seu processo atual seja melhor.