Se você não conseguir alterar o arquivo para root: root; e você é a raiz Então, a situação mais provável é que o parâmetro imutável tenha sido definido no arquivo. Confirme e altere os atributos do arquivo.
# lsattr /etc/yum.conf
----i--------e-- /etc/yum.conf
Se esta for a saída do comando anterior, faça o seguinte.
# chattr -i /etc/yum.conf
# lsattr /etc/yum.conf
-------------e-- /etc/yum.conf