Depois de mexer a maior parte do dia, cheguei à seguinte conclusão:
ntpdate-debian
é a versão a ser usada se você quiser usar um script de configuração e, nesse caso, editar o arquivo /etc/default/ntpdate
.
ntpdate
não pode ser usado sem argumentos nem possui um arquivo de configuração. Se você quiser usar isso para atualizar, você precisa declarar o servidor ntp em um argumento, como ntpdate ntp.ubuntu.com
.