Uma das minhas instalações do Win7 foi semelhante, mas não exatamente como a sua, mas lembro-me da opção dentro do instalador de dvd do Windows 7 para editar e / ou formatar a (s) partição (ões) no disco rígido. Esta seria minha sugestão com base no que você está dizendo. Existem opções de "Live CD" baseadas no linux que incluem ferramentas de disco rígido, não tendo certeza de qual é a sua familiaridade com tudo isso.