Sim. Eu uso CrashPlan.com e eles fornecem essa facilidade. Aqui está uma citação
Flexible Restore Options With CrashPlan backup software, you can go back in time and choose to restore specific versions of files based on date. You can also tell CrashPlan where to save the files when you restore and whether or not to rename them.
Tenho certeza de que outros serviços de backup online devem fornecer a mesma opção. [Eu fui para o Crashplan apenas porque ele armazena meus arquivos excluídos indefinidamente, então ele pode dobrar para liberar o espaço do disco rígido do meu laptop.]