A principal diferença é que o cache de endereços MAC no switch é constantemente alterado em balance-rr, já que o switch acredita que o host se move constantemente entre as duas interfaces. Isso pode sobrecarregar o switch, resultando em desempenho inferior.
Além disso, o tráfego de entrada não será totalmente balanceado, de modo que você só atinja a tolerância contra falhas, mas não a dupla largura de banda. Isso é especialmente perceptível se o host recebe muitos pacotes grandes, mas apenas ocasionalmente envia respostas: A largura de banda não é compartilhada, mas apenas alternada entre as duas portas.