Sim, existe.
Uma ferramenta como o Acronis Disk Director ou qualquer comparável faria isso.
Você precisará, no entanto, inicializar a partir do CD mais leve ou USB ou conectar suas unidades a outro PC.
Pode haver uma forma de algumas ferramentas (como acronis) instalá-las, configurar suas operações de clonagem e executá-las (pode ser necessário reiniciar).
Outras sugestões - veja aqui: link
E a propósito - por que você simplesmente não recoloca o cabo do seu CD / DVD?!