Se eu estou entendendo você, parece um problema de software. Parece que você está dizendo que os pixels e talvez pequenos blocos da tela ficam pretos às vezes, até serem atualizados de alguma forma. Isso geralmente é uma indicação de que o algoritmo "bit-blit" usado para fazer gráficos não foi implementado com muito cuidado. (Sim, eu sei que bit-blit em si é raramente usado, mas a categoria geral de algoritmos permanece.)
Basicamente, quando, por exemplo, mover um mouse através de uma tela, é preciso calcular rapidamente a imagem alterada à medida que o mouse se move sobre uma área da tela e depois restaurar os dados originais com a mesma rapidez após a passagem do mouse. Isso geralmente funciona bem, mas se alguma coisa está acontecendo ao mesmo tempo (por exemplo, outra imagem aparece na tela onde o mouse está se movendo), os dados errados podem ser processados.
A probabilidade de ocorrer esse problema depende de quanto está acontecendo, de quão sobrecarregada está a caixa, da qualidade do código gráfico do monitor e do controlador de exibição de hardware.
Por outro lado, "estrias" de pixels pretos que dançam em toda a tela devem-se a alguma atividade que impede o acesso à memória. Em esquemas que envolvem exibição compartilhada / memória RAM, isso pode ser E / S de disco (que necessariamente precisa de acesso de RAM de prioridade mais alta).