Espero que a resposta à minha pergunta esteja de acordo com as regras deste site. Infelizmente, não é possível melhorar o Zarafa WebAccess para um cliente de email completo, onde um "cliente de email completo" é um aplicativo de terceiros, como o Thunderbird ou o Outlook. Não importa o quão bom você modifique o registro do Windows, alguns aplicativos ainda não mapearão sua função especial "send as mail" para o cliente de email padrão.
Desde que esses clientes não possuam uma possibilidade de configuração para as funções especiais, você não poderá usar o Zarafa WebAccess para eles.
No entanto, o Zarafa fornece um plugin para o OpenOffice e pode valer a pena tentar: link
Além disso, o Zarafa lançará em breve uma nova versão do WebAccess, chamada WebApp. O WebApp pode ser melhor em termos de integração com a área de trabalho e permitirá aprimoramentos por meio de plug-ins. Mas isso é mais um projeto de longo prazo.