Aqui estão duas soluções possíveis .
1) Você precisará baixar o pacote que deseja instalar e instalá-lo através do comando rpm usando a opção --nodeps.
Para baixar o rpms, você deve primeiro garantir que o pacote "yum-utils" esteja instalado porque contém o comando "yumdownloader".
Eu não sei os nomes dos pacotes que você quer instalar, mas digamos que o nome do pacote seja "something-xyz". Aqui estão os comandos para baixar e instalar esse pacote:
# Download the package
yumdownloader something-xyz
# Test whether emacs is the only dependency.
rpm -Uvh --test something-xyz-7.42-9.noarch.rpm
# If emacs is the only dependency, then install the package
rpm -Uvh --nodeps something-xyz-7.42-9.noarch.rpm
Se houver outras dependências, você pode tentar instalar via yum se elas não forem dependentes do emacs. Caso contrário, você precisará fazer o mesmo processo acima para instalá-los.
2) Se tudo isso não funcionar com a instalação manual do emacs, o último recurso seria instalar a versão do emacs que o yum deseja instalar, mas invocar sua própria versão do emacs em vez do yum instala.