Não sei se entendi completamente sua pergunta (ou seu problema), mas tentarei responder o que acho que você está fazendo.
Tente definir o [stage.scaleMode][1] para NO_SCALE . Em seguida, no tempo de execução, verifique o stageWidth e o stageHeight e crie sua cena com base nesses valores. Como sugestão, ao definir o stage.scaleMode try, defina o alinhamento como TOP_LEFT . A menos que scaleMode esteja definido como no_scale , o Flash dimensionará automaticamente as dimensões do estágio declarado para as dimensões do contêiner. Se o scaleMode estiver definido como no_scale , as dimensões declaradas serão ignoradas e as dimensões do contêiner serão usadas para o estágio.