Primeiro, uma palavra de cautela:
Sua placa-mãe no nível do consumidor que "suporta RAID" usa seu próprio RAID de software proprietário (que limita o sistema operacional que você pode usar, geralmente apenas o Windows) ou uma abordagem "híbrida" que usa software proprietário e hardware dedicado (mas ainda não é um controlador RAID completo).
Então, em resposta à sua pergunta: Não, "suporta RAID" não significa necessariamente que tem um controlador RAID.
Além disso, você citou uma série de chipsets, não placas-mãe - o que o chipset suporta é muito menos relevante do que a motherboard suporta, e na verdade o chipset suportando RAID não é t realmente relevante - os fabricantes de placas-mãe podem (e têm sido há anos) colocando RAID (veja o primeiro parágrafo) em suas placas-mãe sem que o chipset central tenha seu próprio suporte para isso.
E para responder à sua segunda pergunta: nada de especial é necessário no disco rígido para ser usado em um RAID (a menos que por algum motivo o controlador / software RAID requeira algo extra, ou não suporte certos tipos / capacidades de discos rígidos).
Se você quer construir um servidor barato, minha recomendação é pular o RAID na placa-mãe por completo (a menos que você esteja pronto para um controlador RAID completo - não é barato, mas você não pode bater o desempenho dessas bestas!) e, em seguida, use uma solução RAID de software; Eu tenho 2 servidores Linux em casa (um servidor de arquivos de alta capacidade, um host de VM de alto desempenho) que usam md para seu RAID de software e funciona soberbamente! Além disso, o preço (gratuito) é muito mais barato do que qualquer coisa que você poderia encontrar no mercado de hardware, e se o sistema falhar por algum motivo (como a placa-mãe que estou substituindo no servidor de arquivos) você é livre para obter praticamente qualquer hardware que você goste - o software, não o hardware, é responsável pela sua matriz RAID, portanto você não pode se encontrar no meio da necessidade de substituir um controlador RAID de hardware que não está mais em produção (um situação que mais do que provavelmente custará todos os seus dados!).