Seria mais simples descompactar tudo no destino e criar a pasta wordpress e depois copiar o conteúdo para a raiz. Ele também fornece uma cópia "não contaminada" para que, se você precisar, possa copiar o conteúdo novamente se algo der errado.
Então, vamos dizer, por exemplo, que sua raiz da web está em:
/home/user/public_html
E quando você descompactar seu upload, ele acaba em
/home/user/public_html/wordpress
O comando para copiar tudo (exceto arquivos ocultos seria)
cp -ax /home/user/public_html/wordpress/* /home/user/public_html/
É muito provável que exista também um arquivo .htaccess, que precisaria de uma cópia separada:
cp /home/user/public_html/wordpress/.htaccess /home/user/public_html/