Não é necessário instalar software na outra partição, se desejar - basta selecionar Instalação personalizada, se necessário, e direcionar o instalador para colocar o programa em uma pasta no D:.
No seu caso, porém, eu recomendaria apenas remover a partição D e expandir C, já que você não tem nenhum uso real para uma unidade particionada dessa maneira. Às vezes, os OEMs fornecem drives com a ideia de que facilitará a recuperação da máquina, mas raramente é possível entender como a maioria dos usuários realmente usa seus sistemas que se beneficiam.