Não há como fazer isso na interface padrão. Alguns aplicativos de terceiros podem fazer isso, mas não tenho certeza do que essa configuração implicaria. (Será que a janela de um aplicativo é redimensionada à medida que você é movida de monitor para monitor?) Talvez o consigamos quando tivermos sistemas operacionais e gerenciadores de janela independentes de resolução.
Infelizmente, a solução agora parece ser mover os monitores para distâncias diferentes de você para que os pixels apareçam do mesmo tamanho.