Você ainda deve conseguir "ejetar" a unidade. Observe de perto os ícones fornecidos na região inferior direita da tela. É provável que um deles remova dispositivos com segurança.
Algo interessante sobre o uso de NTFS em vez de FAT32 em uma unidade USB é que o NTFS é registrado em diário, o que significa que ele mantém um registro de tudo que está fazendo de forma que, se "remover" o dispositivo, as chances de um sistema de arquivos a corrupção é muito menor. Ainda assim, o cache de gravação e coisas do gênero podem levar em consideração, então remover o dispositivo com segurança é certamente uma boa coisa a fazer.
Se a minha sugestão não ajudar, talvez vá para "Meu Computador" e veja se "ejetar" é uma opção quando você clica com o botão direito do mouse sobre o ícone da unidade.