Solução 1 - simples
Faça o download da versão em inglês de DJVU TOY . Isso permite dividir e mesclar documentos como achar melhor. É muito direto. Aqui estão as páginas man . Você precisará do Google translate para traduzir as páginas para o inglês. Eu uso o Chrome, por isso não foi um problema.
Basta dividir o documento inteiro. Altere a ordenação / numeração das páginas na pasta e, em seguida, junte-as.
Solução 2 - mais difícil, o djvuextrato é mal documentado.
Você pode usar DJVUEXTRACT para extrair páginas de um arquivo DJVU e DJVUMAKE para remontar o arquivo.
Todos fazem parte do projeto DJVULibre . É uma biblioteca muito legal e fará a maioria das coisas que você precisa. Ele também roda no Ubuntu.