Talvez o este guia o ajude? Menciona especificamente a formatação usando estilos de parágrafos. Mas é um pouco mais antigo.
Há uma entrada de Perguntas frequentes sobre notas finais que também lida com este tópico, pelo menos de alguma forma :
I have changed my output style from the EndNote program, but the style in my paper keeps reverting to Annotated or some other style I did not choose. How can I correct this?
A solução aparentemente é:
Go to the "Edit" Menu and choose "EndNote Citations> Bibliographic format." Select the style directly from this menu.
To use a style not on the menu, quit Pages and go to EndNote X2 or later program.
In EndNote, go to the Edit Menu and choose "Output Styles > Open Style Manager."
Here, simply place a check in the "Favorites" box in front of the desired Style.
To use the style in Pages 09, close both Pages and EndNote and then open them to see the style in Pages.
Deixe-me saber se isso funciona.