Você quer o afogamento automático? Ou seja, sempre que houver tráfego não BitTorrent, ele deve ser priorizado em relação ao BitTorrent. Ou seria afogar durante certas horas, ou seja, tardes / manhãs quando há probabilidade de haver pessoas usando outros protocolos, ser aceitável? Se este último, muitos clientes BitTorrent podem ser configurados para limitar a largura de banda agregada usada, e fazê-lo em horários programados, e. limitar-se a 20KB / s a montante e a jusante durante o horário de expediente, e correr ilimitadamente (ou seja, normalmente) fora dessas horas.
As diferentes abordagens são realizadas em diferentes locais - a priorização de tráfego aconteceria em seu gateway, enquanto a aceleração do cliente aconteceria em, bem, uma máquina cliente (embora no seu caso o host Debian possa ser tanto o cliente BitTorrent quanto o cliente gateway ...)