Eu acredito que os números são os números de linha dentro do arquivo de origem especificado.
O QuickSynergy apenas chama as ferramentas de linha de comando de sinergia 'padrão'.
Para o Ubuntu, você deve ser capaz de testar a sinergia com:
$ synergyc -f -d 2 <ip of server>
Isso deve iniciar o cliente de sinergia, conectar-se ao servidor e fornecer informações de depuração para o stderr. Você pode usar Ctrl + C para finalizar o cliente.
Para iniciá-lo em segundo plano, você pode usar:
$ synergyc <ip of server>