Problema resolvido.
Tudo o que eu precisava fazer era criar um arquivo no diretório raiz dos jogadores e chamá-lo de .is_audio_player
e colocar as seguintes linhas nele:
audio_folders=Music/
output_formats=audio/ogg,audio/x-ms-wma,audio/mpeg,audio/wav,audio/x-flac,audio/mp3
cover_art_file_type=jpeg
cover_art_file_name=cover.jpg
Os arquivos são transferidos como de costume e o cover.jpg é criado automaticamente!