Em geral, usar repositórios 'ubuntu' não é uma boa idéia, a menos que você esteja certo de que a versão do mint e do ubuntu é a mesma - você pode se safar com PPAs limitados.
Você deve, na maioria das vezes, executar programas individuais, desde que todas as dependências sejam atendidas - portanto, a maneira mais segura de fazer isso é instalar o programa a partir de arquivos deb individuais (com dpkg), instalar suas dependências e testar antes você faz qualquer coisa. Em geral, desde que usem a mesma versão da libc (crucial!) E todas as dependências sejam atendidas, você deve estar bem