Se você quiser fazer tudo isso no Ubuntu - instale o VirtualBox & crie uma VM para o Windows. Instale o Windows dentro da VM (fazendo o boot do ISO baixado - você pode fazer isso usando o VirtualBox).
Depois de ter o Windows 7 instalado na VM, você pode usar a VM do Windows 7 para executar o Ferramenta USB do Windows 7 para tornar o Windows 7 inicializável a partir da unidade USB.
* Sim, eu sei que é muito longo, mas eu fiz isso e funcionou bem quando a minha unidade de DVD se desligou e eu não tive acesso a um sistema Windows.