Depois de ter os lotes digitalizados, ImageJ pode ser pressionado para fazer o trabalho de separar os grupos em imagens individuais. Esta postagem no fórum do ArsTechnica tem um link para o ImageJ e o script necessário para realizar o trabalho.
Dito isto, um serviço de digitalização de fotos como o ScanCafe proporcionará resultados de qualidade muito melhores. Serviços como este terão melhores scanners e ferramentas para garantir que suas digitalizações tenham a melhor aparência possível. Se você não tiver o orçamento para que esse tipo de serviço escaneie todas as suas fotos, fazer com que elas digitalizem seus favoritos pode valer a pena enquanto você faz o resto.