O problema persiste se você tentar copiar com CTRL-Insert e colar usando Shift-Insert? Eu acho que isso é um problema GTK +. Este ticket de suporte (embora antigo) sugere que pode haver um problema com versões posteriores do GTK + em execução em determinadas versões do Windows.
Eu sugiro que você tente instalar algumas versões diferentes do GTK + e veja se o problema persiste. Se bem me lembro, você pode fazer isso mantendo a mesma versão do Pidgin instalada.