Você pode usar o pacote Multimídia para incorporar filmes (mpg, mp4) de uma maneira que você possa reproduzi-los no Okular. Exemplo mínimo:
\documentclass{article}
\usepackage{multimedia}
\begin{document}
\movie[height = 0.6 \textwidth,width = 1.0 \textwidth]{}{animation.mpg}
\end{document}