O antigo formato .doc não suporta os objetos de equação, então eles precisam ser convertidos em algo que .doc faz suporta - ou seja, imagens.
Existe uma razão pela qual você não pode usar o formato mais recente .docx ?
Note que acabei de testar algo e, no Word2007 no Windows, escrevendo uma equação e salvando como .doc , fechando o Word, reabrindo o arquivo e salvando novamente em .docx , reativei a equação para edição. novamente.
Então, tente converter seus arquivos para .docx para ver se isso permite que você edite novamente a equação. Você pode até converter os arquivos de volta para .doc depois, mas pode haver alguns problemas com o layout ou outros elementos, então teste isso primeiro.