Você está usando Linux, Windows ou Mac OS X? Eu uso um programa chamado Jing pela TechSmith. Está disponível para Windows e Mac OS X. Acredito que isso pode ser o que você está procurando. Ele permite que você bloqueie a tela pela janela do Aplicativo, janelas seletivas dentro de um aplicativo, toda a resolução completa do seu monitor e até mesmo selecionando sua própria área da tela a ser capturada. Experimente.