Tente alterar os servidores de atualização e tente novamente
Quando o Update Manager perguntar se deve executar uma Atualização parcial ou não, selecione Não e, em seguida, selecione Atualizar na próxima caixa de diálogo. O Ubuntu irá atualizar o máximo possível. Depois disso, você pode mudar para um servidor diferente.