Se você estiver executando o Windows; O Windows pode ser configurado para executar apenas um núcleo. Um Windows XP o boot.ini pode ser editado manualmente . Adicionar ao final de sua linha de inicialização / numproc = 1 limitará o Windows a um núcleo (já que cada núcleo é considerado uma CPU)
O Vista / 7 é mais complexo. Para o Vista ou o 7, eu usaria o Easy BCD Edit . Use as Configurações avançadas para limitar o Windows em uma CPU.
Além disso, se você quiser apenas limitar um único programa a uma única CPU, poderá usar o procedimento aqui para fazer isso.