Se uma versão do arquivo for a correta, mas você suspeitar que a versão no repositório está incorreta, consulte Como eu posso forçar o subversion a confirmar um arquivo inalterado?
Se você quiser forçar a obtenção dos arquivos do repositório, consulte Força um comando svn checkout para sobrescrever arquivos atuais .
Caso contrário, apenas modifique um dos arquivos, salve-o no repositório como nova revisão e faça o check-out novamente no outro computador como acima.