Você não quer criar partições dentro do Windows para backtrack, deixar como espaço não alocado, quando vai instalar backtrack (eu usei 4, embora eu achei que o particionamento pode ser um pouco complicado) não selecionar "use o disco inteiro", mas há 1 sobre o uso de partições atuais (provavelmente logo abaixo), se não tentar usar manual, e fazer partições diretamente daqui. Infelizmente o criador da partição de backtrack não é útil, mas se você mexer com isso o suficiente, você deve ser capaz de instalar backtrack sem arruinar suas outras partições.