Tem a certeza de que está a ver toda a extensão. Se você tiver hide tipos de arquivos conhecidos, poderá ver file.exe.txt
as file.exe
. Para um teste, tente iniciar um exe com cmd e veja se você pode executá-lo dessa maneira.
Clique com o botão direito do mouse nas propriedades e encontre o alvo que tenta iniciar o exe atual e não o link.