Isso é provavelmente apenas o terminal dentro da GUI que terá esse problema, já que está sendo desenhado pelo servidor X. Ctrl + Alt + F1 através de Ctrl + Alt + F6 são todos terminais virtuais baseados em console. O primeiro terminal provavelmente está sendo usado pelo servidor X. Você pode pressionar Ctrl + C para interromper sua execução, e então prosseguir com os seguintes passos:
Remova completamente seu servidor X:
sudo apt-get remove x-window-system-core xserver-xorg
depois, reinstale:
sudo apt-get install x-window-system-core xserver-xorg