Parece que descobri por mim mesmo ... É um "recurso" do compiz. A solução é explicada aqui:
link
Compiz uses small, 2 pixels wide windows to detect edge actions. Unfortunately, it's not possible to pass the enter/leave/motion events to the window beneath with the X infrastructure as it stands :-/
You probably want to disable the top and/or bottom edges in the wall plugin (under "Key bindings" -> "Edge flipping").
Eu não dependo muito desse recurso de virada de borda, então isso corrige isso para mim.