Qual é o relógio da VM exibido nesses horários? Pode ser algo estranho em qualquer combinação de sincronização de relógio (se houver). Se o VMWare está atrasando muito o relógio da VM para tentar explicar o que pensa ser o tempo da VM chegar muito à frente, isso pode explicar time
retornando um tempo de relógio de 0 e superior (o que leva algumas leituras, aguarda um segundo mais ou menos, faz mais algumas leituras, depois atualiza sua exibição) pausando esperando que o (s) segundo (s) toque (m).
Se o relógio parece estar onde não deveria estar: Eu acho que a maneira mais confiável de manter os relógios da VM precisos é garantir que as opções de sincronização do relógio da VMWare estejam desligadas e usar NTP com tinker panic 0
no topo do arquivo de configuração.