Eu acho que você deveria marcar os dois. Em média, você tem 45 fotos por álbum.
Não sei ao certo como você decidiu estruturar seus álbuns, mas em qualquer caso, 45 fotos significa que você tem uma grande quantidade de informações em cada álbum que pode precisar de marcação (e não há nada de errado em ter mais de uma foto com as mesmas tags). Da mesma forma, 200 álbuns é um número impressionante e indica claramente que você tem algum propósito para eles. Então, marcar isso parece natural.
Um pensamento no entanto você deve ter presente ... você deve sempre considerar sua unidade de informação como seu alvo prioritário para a marcação. Neste caso (e basicamente no caso de computadores), este é o arquivo. Assim, a questão para marcar ou não arquivos nunca deve ser colocada. Em vez disso, são apenas os álbuns que podem trazer a dúvida. Com esse número, no entanto, sugiro que você os marque, caso queira fazer uma pesquisa de álbum.