As alterações monitoradas estão ativadas ou desativadas para todo o documento. Não pode ser ativado para funcionar apenas pela seção do documento.
Acredito que a sua melhor alternativa alternativa pode ser uma macro que controlou o processo de edição em conjunto com o bloqueio e desbloqueio das seções protegidas e, em seguida, ativar / desativar as alterações controladas.