Se outras pessoas acabarem aqui, tente:
1. O que @xenoid disse
1) Check that you can start these programs from a terminal and that they still run (they could have dependencies not resolved on the new system).
2) Create a
{application}.desktop
file for each of them (there must be an application menu editor somewhere in your system).
2. Se isso falhar
Em seguida, tente reinstalar seus programas. A instalação pode ser ou não mais rápida, pois você tem seus arquivos na partição /home
.
Sinta-se à vontade para adicionar sua própria resposta.