Você não pode desabilitar isso (bem ... você pode editar arquivos plist, mas isso é desajeitado e requer trabalho. Não há nenhuma caixa de seleção nas suas preferências de sistema para desativá-lo.)
Tente isso:
Em vez de usar o modo de tela inteira padrão da Apple, use o antigo (melhor) modo de tela cheia do OS-X:
Hold shift + option while clicking the green "full-screen" button.