Eu baseio minha resposta no pressuposto de que você está no Windows, e eu acho que a GoPro produz arquivos de vídeo .mp4 (a resposta pode ser facilmente adaptada a outros tipos de vídeo).
Você precisa primeiro instalar ffmpeg como sua ferramenta para se juntar aos arquivos de vídeo.
Um arquivo em lotes (.bat) com os seguintes comandos se juntará os arquivos de vídeo na pasta atual:
(for %%i in (*.mp4) do @echo file '%%i') > mylist.txt
ffmpeg -f concat -i mylist.txt -c copy output.mp4
Para mais informações, incluindo instruções para o Linux, veja o artigo ffmpeg wiki para o Concatenando arquivos de mídia .