Eu acho que o gerenciador de inicialização do seu sistema está corrompido. Uma nova instalação do Ubuntu deve reinstalá-lo, mas de alguma forma não aconteceu.
Inicialize o sistema usando o live disk do Ubuntu, chroot no diretório raiz da instalação do Ubuntu e reinstale o grub2 bootloader. Para mais instruções sobre o procedimento de instalação de grub2 , vários documentos on-line estão disponíveis.
Agora reinicie seu sistema e verifique se o seu disco rígido é o primeiro dispositivo inicializável.