A única maneira de instalar o VLC 3.0 através de um PPA é adicionando o PPA master-daily ao seu sistema e o PPA provavelmente ainda está lá.
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Tipo:
sudo apt-get purge vlc sudo add-apt-repository --remove ppa:videolan/master-daily sudo apt-get update
para desinstalar o vlc e remover esse PPA do seu sistema.
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Digite os três comandos a seguir para excluir todas as configurações de vlc da sua pasta pessoal:
rm -R ~/.config/vlc rm -R ~/.cache/vlc rm -R ~/.local/share/vlc
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Instale vlc dos repositórios da maneira usual.