Você pode tentar desativar o serviço de Superfetch se estiver usando um HDD.
Pressione Windows + R, digite services.msc
e o Superfetch pode ser desativado a partir daí.
Quando eu estava instalando o Windows 10 em alguns novos laptops, tive problemas semelhantes, e isso ajudou a aliviar o problema de uso do disco. Isso pode não ser aplicável se você estiver usando um SSD.
Ouvi dizer que o serviço do BITS também pode causar problemas de uso do disco, mas não tenho certeza disso.